На флэшке появляются новые файлы

Нифига. Трабла в самом приложении "Фотоаппарат", которое хреново работает с картой памяти (или что-то вроде этого). Короче, криворуко эту часть софта отлаживали и как результат - тел портит содержимое карточки (не саму карту). Данные, тем не менее, можно восстановить любой прогой для спасения данных с флешек. Качество сборки влияет, может быть - у меня румынская, так да, галимовато.
А решается эффективно, но не очень удобно - ставите в настройках камеры сохранение фоток на память телефона, а когда он их там конвертанёт из своего формата в джпег, то перемещаете оттуда на карту в нужную папку... Практически без проблем, но геморно, когда нужно отщёлкать десятки фотографий за раз. За один приём можно сделать 5-6 фоток "в память", потом нужно ждать, пока он хотя бы 1-2 фотки сконвертирует в джпег, тогда место в памяти телефона освобождается.
Также, если много делаете фото - имейте при себе ещё пару запасных карт памяти хоть по 256-512 метров. Если тел данные запорет, то просто выключите, поменяйте карту, дальше фоткайте. Так можно и фоткать прямо на карточки, т. к. тел лагает не очень часто - зато большое кол-во фоток можно нашлёпать при такой страховке.
Кроме того, не отмечайте фотки и не пытайтесь это делать, а также копировать, ещё не сконвертированные в джпег - будут лаги с именами файлов, они будут повторяться/совпадать, причём - произвольно. Отмечайте и копируйте только то, что уже сконвертировано, или ждите, пока все фотки будут в джпег и потом, отметив всё, перемещайте на карту.
Также, "фотоаппарат" периодически подвисает, но потом "размораживается" и продолжает работу. Видимо, при работе с памятью телефона эти лаги "проходят" без проблем, а вот при работе с картой - он то недозаписывает чего-то, то отключается от карты, то запарывает содержимое.
Поэтому один совет - фотки "пропускать" через память тела, а уж потом - кидать их на карту.

Подключите телефон к компьютеру через USB-кабель и проверьтена наличие вирусов